Paquet : r-bioc-htsfilter (1.42.0+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-htsfilter  ]

GNU R filter replicated high-throughput transcriptome sequencing data

This package implements a filtering procedure for replicated transcriptome sequencing data based on a global Jaccard similarity index in order to identify genes with low, constant levels of expression across one or more experimental conditions.

Autres paquets associés à r-bioc-htsfilter

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• dep: r-api-bioc-3.18

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-deseq2

  R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

• dep: r-bioc-edger

  analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R

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• sug: r-bioc-edaseq

  GNU R exploratory data analysis and normalization for RNA-Seq

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

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