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Paquet : qiime (2019.4.0-1 et autres)

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Paquets similaires :

QIIME, Quantitative Insights Into Microbial Ecology

QIIME 2 est un paquet pour l’analyse de microbiome, extensible et décentralisée avec une attention particulière sur la transparence des données et analyses. QIIME 2 permet aux chercheurs de commencer une analyse avec des données de séquences d’ADN et de terminer avec des figures et des résultats statistiques de qualité professionnelle. Principales caractéristiques :

 — suivi intégré et automatique de la provenance des données ;
 — système de type sémantique ;
 — système de greffons pour étendre les fonctionnalités d’analyse de
   microbiome ;
 — prise en charge de plusieurs types d’interface (par exemple, API,
   ligne de commande, graphique) ;

QIIME 2 est une nouvelle conception et une réécriture de la tuyauterie d’analyse de microbiome, QIIME 1. QIIME 2 corrigera la plupart des limitations de QIIME 1, tout en conservant les fonctions qui font de QIIME 1 une tuyauterie d’analyse puissante et largement utilisée.

QIIME 2 actuellement prend en charge une première tuyauterie d’analyse de microbiome de bout en bout. De nouvelles fonctionnalités seront régulièrement disponibles à travers des greffons de QIIME 2. Une liste de greffons peut être consultée sur la page de disponibilité de greffons de QIIME 2. La page des futurs greffons liste les greffons en cours de développement.

Autres paquets associés à qiime

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Architecture Version Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
all 2019.4.0-1 132,9 ko957,0 ko [liste des fichiers]
alpha (portage non officiel) 1.9.1+dfsg-1+b1 1 652,2 ko12 240,0 ko [liste des fichiers]
arm64 (portage non officiel) 1.8.0+dfsg-4 1 310,9 ko9 506,0 ko [liste des fichiers]
hppa (portage non officiel) 1.9.1+dfsg-1+b1 1 809,2 ko13 153,0 ko [liste des fichiers]
m68k (portage non officiel) 1.9.1+dfsg-1 1 282,9 ko9 258,0 ko [liste des fichiers]
powerpcspe (portage non officiel) 1.9.1+dfsg-1 1 359,4 ko9 676,0 ko [liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel) 1.9.1+dfsg-1+b2 1 276,3 ko10 815,0 ko [liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel) 1.9.1+dfsg-1+b2 1 213,0 ko8 889,0 ko [liste des fichiers]
x32 (portage non officiel) 1.9.1+dfsg-1+b1 1 968,8 ko9 363,0 ko [liste des fichiers]