Paquet : python3-mappy (2.27+dfsg-1 et autres)

[ Paquet source : minimap2  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Autres paquets associés à python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.11) [x32]

  dep: python3 (<< 3.13) [non x32]

  dep: python3 (>= 3.10~) [x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [non x32]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger python3-mappy

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.26+dfsg-1	210,2 ko	956,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.27+dfsg-1	175,9 ko	671,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.27+dfsg-1	167,3 ko	695,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.27+dfsg-1	188,7 ko	777,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.27+dfsg-1	190,7 ko	561,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.27+dfsg-1	226,9 ko	907,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.27+dfsg-1	225,1 ko	985,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.24+dfsg-3+b1	256,8 ko	1 500,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.27+dfsg-1	187,0 ko	799,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.27+dfsg-1	195,8 ko	977,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.27+dfsg-1	215,4 ko	1 079,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.27+dfsg-1	200,1 ko	951,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.27+dfsg-1	222,9 ko	679,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.27+dfsg-1	227,8 ko	955,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.24+dfsg-3+b2	233,3 ko	693,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.27+dfsg-1	183,0 ko	2 115,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.24+dfsg-2+b1	143,0 ko	341,0 ko	[liste des fichiers]