Paquet : r-bioc-summarizedexperiment (1.32.0+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-summarizedexperiment  ]

BioConductor assay container

The SummarizedExperiment container contains one or more assays, each represented by a matrix-like object of numeric or other mode. The rows typically represent genomic ranges of interest and the columns represent samples.

Autres paquets associés à r-bioc-summarizedexperiment

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

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  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.27.1)

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.13.1)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.1.3)

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-s4arrays (>= 1.1.1)

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.33.7)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• sug: r-bioc-annotate

  annotations de BioConductor pour les puces à ADN

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  GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor

• sug: r-bioc-biocstyle

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• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-hdf5array (>= 1.7.5)

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• sug: r-bioc-rhdf5

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• sug: r-cran-digest

  GNU R package for 'hash digest' of R data structures

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

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