Paquet : r-bioc-metagenomeseq (1.43.0-2)

[ Paquet source : r-bioc-metagenomeseq  ]

GNU R statistical analysis for sparse high-throughput sequencing

MetagenomeSeq is designed to determine features (be it Operational Taxanomic Unit (OTU), species, etc.) that are differentially abundant between two or more groups of multiple samples. metagenomeSeq is designed to address the effects of both normalization and under-sampling of microbial communities on disease association detection and the testing of feature correlations.

Autres paquets associés à r-bioc-metagenomeseq

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-limma

  modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)

• dep: r-bioc-wrench

  normalisation wrench de GNU R pour des données éparses de comptage

• dep: r-cran-foreach

  GNU R foreach looping support

• dep: r-cran-glmnet

  Lasso and Elastic-Net Regularized Generalized Linear Models

• dep: r-cran-gplots

  paquet de GNU R d’outils de tracé de données de Greg Warnes et autres

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• sug: r-bioc-annotate

  annotations de BioConductor pour les puces à ADN

• sug: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• sug: r-bioc-biomformat

  GNU R interface package for the BIOM file format

• sug: r-bioc-ihw

  GNU R independent hypothesis weighting

• sug: r-cran-gss

  GNU R package for multivariate estimation using smoothing splines

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-testthat (>= 0.8)

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-vegan

  Community Ecology Package for R

Télécharger r-bioc-metagenomeseq

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	2 065,3 ko	2 617,0 ko	[liste des fichiers]