Paquet : ampliconnoise (1.29-11)

[ Paquet source : ampliconnoise  ]

suppression du bruit pour les amplicons PCR séquencés 454

AmpliconNoise est un ensemble d'applications pour nettoyer les données de séquences haute fréquence. Il est constitué de trois parties principales :  

 - Pyronnoise : rassemble les mauvais points en se basant sur un
    diagramme de flux ;
 - SeqNoise : enlève les mutations de point PCR ;
 - Perseus : enlève les chimères PCR sans avoir besoin d'un ensemble de
    séquences de références.

Étiquettes: Rôle: Programme

Autres paquets associés à ampliconnoise

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: mafft

  programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

• rec: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Télécharger ampliconnoise

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64el	1 094,5 ko	2 589,0 ko	[liste des fichiers]