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Paquet : plink (1.07+dfsg-2)

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whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

Please note: The executable was renamed to plink1 because of a name clash. Please read more about this in /usr/share/doc/plink/README.Debian.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, But: Analyse

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
alpha (portage non officiel) 1 086,6 ko3 887,0 ko [liste des fichiers]
amd64 1 086,4 ko3 193,0 ko [liste des fichiers]
arm64 936,3 ko2 769,0 ko [liste des fichiers]
armel 937,0 ko2 832,0 ko [liste des fichiers]
armhf 956,8 ko1 984,0 ko [liste des fichiers]
hppa (portage non officiel) 1 021,9 ko2 993,0 ko [liste des fichiers]
hurd-i386 1 156,8 ko3 556,0 ko [liste des fichiers]
i386 1 157,4 ko3 556,0 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-amd64 1 086,9 ko3 209,0 ko [liste des fichiers]
kfreebsd-i386 1 157,5 ko3 548,0 ko [liste des fichiers]
m68k (portage non officiel) 1 022,9 ko3 124,0 ko [liste des fichiers]
mips 950,1 ko3 761,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 943,3 ko3 658,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 969,3 ko3 765,0 ko [liste des fichiers]
powerpcspe (portage non officiel) 992,5 ko3 252,0 ko [liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel) 1 024,4 ko3 509,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 1 057,0 ko3 381,0 ko [liste des fichiers]
riscv64 (portage non officiel) 1 072,4 ko2 557,0 ko [liste des fichiers]
s390x 961,7 ko3 220,0 ko [liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel) 1 441,9 ko3 036,0 ko [liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel) 919,5 ko3 066,0 ko [liste des fichiers]
x32 (portage non officiel) 1 088,3 ko3 044,0 ko [liste des fichiers]