Paquet : r-bioc-delayedarray (0.28.0+dfsg-1) [debports]

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opérations de Bioconductor différées pour des objets de type tableau

L’emballage d’un objet de type tableau (classiquement des objets sur le disque) dans un objet DelayedArray permet de réaliser des opérations classiques sur des tableaux sans charger l’objet en mémoire. Dans le but de réduire l’utilisation de la mémoire et d’optimiser les performances, les opérations sur l’objet sont soit différées, soit exécutées en utilisant un mécanisme de traitement de blocs. Il est à noter que cela fonctionne aussi sur des objets de type tableau en mémoire tels que des objets DataFrame (classiquement avec des colonnes Rle), des objets Matrix, des tableaux ordinaires et des trames de données.

Autres paquets associés à r-bioc-delayedarray

• dep: libc6 (>= 2.4)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  Paquet indisponible

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.43.4)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.17.3)

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-matrixgenerics (>= 1.1.3)

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-s4arrays (>= 1.1.1)

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.2)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-sparsearray (>= 1.1.10)

  efficient in-memory representation of multidimensional sparse arrays

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-delayedmatrixstats

  fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »

• sug: r-bioc-genefilter

  méthodes de filtrage de gènes à partir d’expériences sur puce

• sug: r-bioc-hdf5array (>= 1.17.12)

  HDF5 backend for DelayedArray objects

• sug: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-lobstr

  visualize R data structures with trees

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

Télécharger r-bioc-delayedarray

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