Paquet : libbam-dev (0.1.19+dfsg-6 et autres)

[ Paquet source : samtools-legacy  ]

manipulation d'alignements de séquences de nucléotides au format BAM ou SAM

La bibliothèque BAM fournit les entrées et sorties et diverses opérations de manipulation d'alignements de séquences de nucléotides au format BAM (Binary Alignment/Mapping) ou SAM (Sequence Alignment/Map). Elle gère actuellement l'importation à partir de et l'exportation vers SAM, le tri, la fusion, la génération au format «⋅pileup⋅» et la récupération rapide de lectures chevauchantes dans une région spécifique.

Cette bibliothèque fait partie de SAMtools version⋅0.1.19. Elle est obsolète et n'est fournie que pour la construction de logiciels qui n'ont pas encore fait leur transition vers HTSlib qui remplace cette bibliothèque.

Étiquettes: Développement de logiciel: Bibliothèques, Rôle: Bibliothèque de programmation

Autres paquets associés à libbam-dev

• dep: zlib1g-dev

  bibliothèque de compression — paquet de développement

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.1.19+dfsg-6	132,8 ko	565,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.1.19+dfsg-6	115,4 ko	384,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.1.19+dfsg-6	107,9 ko	372,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.1.19+dfsg-6	103,1 ko	307,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.1.19+dfsg-6	102,3 ko	258,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.1.19+dfsg-6	116,2 ko	347,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.1.19+dfsg-6	126,8 ko	362,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.1.19+dfsg-6	149,2 ko	592,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.1.19+dfsg-6	100,5 ko	303,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.1.19+dfsg-6	119,1 ko	478,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.1.19+dfsg-6	123,6 ko	455,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.1.19+dfsg-6	128,0 ko	456,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.1.19+dfsg-6+b1	244,6 ko	1 922,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.1.19+dfsg-6	109,6 ko	396,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.1.19+dfsg-6	122,6 ko	287,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.1.19-2	114,5 ko	427,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.1.19+dfsg-6	115,3 ko	330,0 ko	[liste des fichiers]