Paquet : libjgromacs-java (1.0-1.1)

[ Paquet source : jgromacs  ]

library for molecular dynamics trajectory analysis

JGromacs is a Java library designed to facilitate the development of cross-platform analysis applications for Molecular Dynamics (MD) simulations. The package contains parsers for file formats applied by GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations), one of the most widely used MD simulation packages.

JGromacs provides a multilevel object-oriented representation of simulation data to integrate and interconvert sequence, structure and dynamics information. In addititon, a basic analysis toolkit is included in the package. The programmer is also provided with simple tools (e.g. XML-based configuration) to create applications with a user interface resembling the command-line UI of Gromacs applications.

Autres paquets associés à libjgromacs-java

• dep: libjama-java

  Basic linear algebra library for Java

• sug: gromacs

  Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

  ou gromacs-openmpi

  simulation de dynamique moléculaire, binaires pour la parallélisation avec OpenMPI

• sug: libjgromacs-java-doc

  library for molecular dynamics trajectory analysis (documentation)

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