Paquet : harvest-tools (1.3-8 et autres)

[ Paquet source : harvest-tools  ]

archivage et post-traitement d’alignements multiples génomiques « reference-compressed »

HarvestTools est un outil pour créer et interfacer des fichiers Gingr, qui sont des archives performantes de la suite Harvest pour stocker des alignements multiples dans le mode « reference-compressed », des arbres phylogénétiques, des variantes filtrées et des annotations. Bien que conçu pour être utilisé avec Parsnp et Gingr, HarvestTools peut être aussi utilisé pour des conversions génériques entre les formats de fichiers bio-informatiques.

Autres paquets associés à harvest-tools

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libcapnp-0.7.0 [m68k]

  bibliothèque⋅C++ Cap'n Proto

• dep: libcapnp-0.9.1 [hppa]

  bibliothèque⋅C++ Cap'n Proto

• dep: libcapnp-1.0.1 [non hppa, m68k]

  bibliothèque⋅C++ Cap'n Proto

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4) [alpha]

  protocol buffers C++ library

• dep: libprotobuf32 (>= 3.21.12) [hppa]

  protocol buffers C++ library

• dep: libprotobuf32t64 (>= 3.21.12) [non alpha, hppa]

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger harvest-tools

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.3-8+b4	134,9 ko	533,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.3-8+b4	148,9 ko	475,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.3-8+b4	122,8 ko	467,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.3-8+b6	114,0 ko	386,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.3-8+b6	118,7 ko	286,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.3-8+b3	132,0 ko	402,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.3-8+b4	155,9 ko	478,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.3-8+b4	132,6 ko	442,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.3-8+b4	132,7 ko	556,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.3-8+b4	140,8 ko	595,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.3-8+b4	142,7 ko	531,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.3-8+b3	139,0 ko	355,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.3-8+b4	136,0 ko	451,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.3-8+b4	161,2 ko	467,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.3-8+b4	111,2 ko	1 048,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.3-8+b4	149,5 ko	450,0 ko	[liste des fichiers]