Paquet : r-bioc-multtest (2.58.0-1 et autres)

[ Paquet source : r-bioc-multtest  ]

test d’hypothèses multiples basé sur le ré-échantillonnage de Bioconductor

Ce paquet concerne les procédures de bootstrap non paramétrique et de tests de permutation multiple basé sur le ré-échantillonnage (incluant les méthodes empiriques de Bayes) pour contrôler le taux d’erreur FEWR (family-wise error rate), celui gFWER (generalized family-wise error rate), la probabilité TPPFP (probabilité de queue de proportion de faux positifs), le FDR (taux de fausses découvertes). Plusieurs choix de distributions à hypothèse nulle basées sur bootstrap sont implémentés (centré, centré et échelonné, transformé en quantile). Les méthodes par simple pas ou pas à pas sont disponibles. Des tests basés sur une variété de t- et F-statistics (incluant t-statistics basé sur des paramètres de corrélation) sont fournis. Lors de l’examen d’hypothèses avec t-statistics, l’utilisateur peut aussi choisir une distribution « nulle » potentiellement plus rapide qui est normale multivariée avec moyenne zéro et une matrice variance covariance dérivée de la fonction d’influence de vecteur. Les résultats sont rapportés sous forme de valeurs-p ajustées, de régions de confiance et de seuils de statistiques de test. Les procédures sont directement applicables pour identifier de manière différentielle les gènes exprimés dans des expériences de puce à ADN.

Autres paquets associés à r-bioc-multtest

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [non alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-cran-mass

  paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley

• dep: r-cran-survival

  paquet GNU R pour l'analyse de survie

• sug: r-cran-snow

  paquet de GNU R pour un réseau simple de stations de travail

Télécharger r-bioc-multtest

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.58.0-1	818,2 ko	1 070,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.58.0-1	818,2 ko	1 054,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.58.0-1	816,5 ko	1 071,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.58.0-1	816,8 ko	1 050,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.58.0-1	814,3 ko	1 038,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.58.0-1	818,6 ko	1 063,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.58.0-1	820,9 ko	1 065,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.58.0-1	824,4 ko	1 102,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.58.0-1	813,5 ko	1 046,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.58.0-1	816,0 ko	1 075,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.58.0-1	822,6 ko	1 136,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.58.0-1	822,6 ko	1 071,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.58.0-1+b1	817,9 ko	1 048,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.58.0-1	821,7 ko	1 066,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.58.0-1	818,1 ko	1 070,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.58.0-1	814,5 ko	2 032,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.58.0-1	817,3 ko	1 049,0 ko	[liste des fichiers]