Paquet : r-bioc-genomicranges (1.54.1+dfsg-1 et autres)
Liens pour r-bioc-genomicranges
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source r-bioc-genomicranges :
- [r-bioc-genomicranges_1.54.1+dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-genomicranges_1.54.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-genomicranges_1.54.1+dfsg-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
The ability to efficiently store genomic annotations and alignments is playing a central role when it comes to analyze high-throughput sequencing data (a.k.a. NGS data). The package defines general purpose containers for storing genomic intervals as well as more specialized containers for storing alignments against a reference genome.
Autres paquets associés à r-bioc-genomicranges
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- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [non alpha, arm64, hppa, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
-
- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.18
- paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.31.2)
- conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
-
- sug: r-bioc-annotate
- annotations de BioConductor pour les puces à ADN
-
- sug: r-bioc-annotationdbi
- GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor
-
- sug: r-bioc-annotationhub
- client GNU R pour accéder aux ressources d'AnnotationHub
-
- sug: r-bioc-biobase
- fonctions de base pour Bioconductor
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-biostrings (>= 2.25.3)
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- sug: r-bioc-bsgenome
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
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- sug: r-bioc-deseq2 [non m68k]
- R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
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- sug: r-bioc-dexseq
- GNU R inference of differential exon usage in RNA-Seq
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- sug: r-bioc-edger
- analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R
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- sug: r-bioc-genomicalignments
- BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
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- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
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- sug: r-bioc-gviz
- Plotting data and annotation information along genomic coordinates
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- sug: r-bioc-keggrest
- GNU R client-side REST access to KEGG
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- sug: r-bioc-rsamtools (>= 1.13.53)
- importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R
-
- sug: r-bioc-rtracklayer
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
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- sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 0.1.5)
- BioConductor assay container
-
- sug: r-bioc-variantannotation
- BioConductor annotation of genetic variants
-
- sug: r-cran-digest
- GNU R package for 'hash digest' of R data structures
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-matrix
- paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses
-
- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
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- sug: r-cran-runit
- paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires
Télécharger r-bioc-genomicranges
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|---|
alpha (portage non officiel) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 783,9 ko | 2 804,0 ko | [liste des fichiers] |
amd64 | 1.54.1+dfsg-1 | 1 783,9 ko | 2 789,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 1.54.1+dfsg-1 | 1 783,5 ko | 2 805,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 1.54.1+dfsg-1 | 1 781,4 ko | 2 776,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 1.54.1+dfsg-1 | 1 781,6 ko | 2 768,0 ko | [liste des fichiers] |
hppa (portage non officiel) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 783,6 ko | 2 790,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 1.54.1+dfsg-1 | 1 784,1 ko | 2 796,0 ko | [liste des fichiers] |
ia64 (portage non officiel) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 783,4 ko | 2 812,0 ko | [liste des fichiers] |
m68k (portage non officiel) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 781,8 ko | 2 780,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 1.54.1+dfsg-1 | 1 781,3 ko | 2 810,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64 (portage non officiel) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 785,2 ko | 2 869,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 1.54.1+dfsg-1 | 1 783,8 ko | 2 805,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 1.54.1+dfsg-1+b1 | 1 784,0 ko | 2 782,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 1.54.1+dfsg-1 | 1 783,0 ko | 2 789,0 ko | [liste des fichiers] |
sh4 (portage non officiel) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 781,9 ko | 2 804,0 ko | [liste des fichiers] |
sparc64 (portage non officiel) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 782,0 ko | 3 765,0 ko | [liste des fichiers] |
x32 (portage non officiel) | 1.54.1+dfsg-1 | 1 784,3 ko | 2 788,0 ko | [liste des fichiers] |