Paquet : r-bioc-ballgown (2.34.0+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-ballgown  ]

analyse d'expression différentielle flexible au niveau des isoformes

Il s'agit d'outils pour l'analyse statistique de transcriptomes assemblés, y compris l'analyse d'expression différentielle flexible, la visualisation de structures de transcripts, de correspondances de transcripts assemblés avec des annotations.

Autres paquets associés à r-bioc-ballgown

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.25.0)

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodb

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.17.25)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 1.99.22)

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-limma

  modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.29.25)

  GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.9.39)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-sva

  GNU R Surrogate Variable Analysis

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-markdown

  GNU R package providing R bindings to the Sundown Markdown rendering library

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Télécharger r-bioc-ballgown

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	2 859,1 ko	4 505,0 ko	[liste des fichiers]