Paquet : fml-asm (0.1+git20190320.b499514-1 et autres)

[ Paquet source : fermi-lite  ]

outil pour l’assemblage Illumina de lectures courtes pour de petites régions

Fml-asm est un outil en ligne de commande pour l’assemblage Illumina de lectures courtes pour des régions de taille 100 à 10 millions de paires de base, basé sur la bibliothèque fermi-lite. C’est une version en mémoire largement plus légère de fermikit sans génération de fichiers intermédiaires. Il hérite des performances, de l’empreinte mémoire relativement petite et des fonctions de fermikit. En particulier, fermi-lite est capable de conserver les évènements hétérozygotes et peut donc être utilisée pour assembler des régions diploïdes dans le but de détecter les variants.

Autres paquets associés à fml-asm

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k, sh4]

  bibliothèque de prise en charge fournissant des fonctions internes __atomic

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger fml-asm

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.1+git20190320.b499514-1+b1	74,7 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.1+git20190320.b499514-1+b1	66,9 ko	152,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.1+git20190320.b499514-1+b1	61,6 ko	148,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.1+git20190320.b499514-1+b1	65,9 ko	159,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.1+git20190320.b499514-1+b1	66,6 ko	119,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.1+git20190320.b499514-1+b1	82,6 ko	201,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.1+git20190320.b499514-1+b1	83,4 ko	199,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.1+git20190320.b499514-1+b1	97,3 ko	314,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.1+git20190320.b499514-1+b1	71,1 ko	163,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.1+git20190320.b499514-1+b1	69,3 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.1+git20190320.b499514-1+b1	79,0 ko	276,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.1+git20190320.b499514-1+b1	77,1 ko	212,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.1+git20190320.b499514-1+b1	72,3 ko	132,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.1+git20190320.b499514-1+b1	63,2 ko	168,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.1+git20190320.b499514-1+b1	92,8 ko	151,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.1+git20190320.b499514-1+b1	60,0 ko	149,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.1+git20190320.b499514-1+b1	66,5 ko	151,0 ko	[liste des fichiers]