Paquet : embassy-domsearch (1:0.1.660-4 et autres)

[ Paquet source : embassy-domsearch  ]

commandes supplémentaires EMBOSS pour la recherche dans les domaines de la protéine

Les logiciels domsearch ont été développés par Jon Ison et ses collègues pour le projet HGMP (« Human Genome Mapping Project » − projet de cartographie du génome humain) au Medical Research Council (MRC) en Angleterre, pour leurs recherches dans le domaine de la protéine. Ils sont inclus dans un paquet embassy comme un travail en cours.

Les logiciels de cette publication de domsearch sont :

 - seqfraggle : supprime des séquences de fragments des fichiers DHF ;
 - seqnr : supprime la redondance des fichiers DHF ;
 - seqsearch : crée des succès (« hits ») PSI-BLAST (de fichier DHF) à
    partir d'un fichier DAF ;
 - seqsort : supprime les séquences classifiées ambigues des fichiers DHF ;
 - seqwords : crée des fichiers DHF à partir de la recherche par mot-clé
    de la base de données UniProt.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: Analyse

Autres paquets associés à embassy-domsearch

• dep: emboss-lib (<< 6.6.1~)

  EMBOSS Libraries

  dep: emboss-lib (>= 6.6.0+dfsg) [non m68k, sh4, x32]

  dep: emboss-lib (>= 6.6.0-1~) [m68k, sh4, x32]

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libx11-6

  bibliothèque X11 partie client

• rec: emboss

  ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne

• sug: embassy

  Paquet indisponible

Télécharger embassy-domsearch

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1:0.1.660-4	58,8 ko	833,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1:0.1.660-4	59,7 ko	609,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1:0.1.660-4	58,3 ko	833,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1:0.1.660-3	59,4 ko	570,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1:0.1.660-4	63,2 ko	608,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1:0.1.660-3	60,5 ko	581,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1:0.1.660-4	58,9 ko	836,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1:0.1.660-4	60,2 ko	833,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1:0.1.660-4	60,2 ko	833,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1:0.1.660-4	58,1 ko	573,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1:0.1.660-3	61,8 ko	569,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1:0.1.660-4	59,0 ko	5 640,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1:0.1.660-3	60,3 ko	585,0 ko	[liste des fichiers]