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Paquet : dascrubber (1.1-4)

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Paquets similaires :

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).
Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Autres paquets associés à dascrubber

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  • recommandations
  • suggestions
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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
alpha (portage non officiel) 159,8 ko1 381,0 ko [liste des fichiers]
amd64 163,9 ko1 185,0 ko [liste des fichiers]
arm64 141,9 ko1 113,0 ko [liste des fichiers]
armel 139,8 ko1 139,0 ko [liste des fichiers]
armhf 137,6 ko803,0 ko [liste des fichiers]
hppa (portage non officiel) 150,4 ko1 169,0 ko [liste des fichiers]
i386 157,6 ko1 327,0 ko [liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel) 185,4 ko2 282,0 ko [liste des fichiers]
m68k (portage non officiel) 141,1 ko1 139,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 135,7 ko1 217,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 142,5 ko1 279,0 ko [liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel) 154,2 ko1 725,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 165,7 ko1 789,0 ko [liste des fichiers]
riscv64 (portage non officiel) 144,1 ko809,0 ko [liste des fichiers]
s390x 155,1 ko1 237,0 ko [liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel) 159,6 ko999,0 ko [liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel) 130,1 ko1 159,0 ko [liste des fichiers]
x32 (portage non officiel) 158,9 ko1 151,0 ko [liste des fichiers]