Paquet : comet-ms (2019015+cleaned1-4.1 et autres)

[ Paquet source : comet-ms  ]

moteur de recherche de spectrométrie de masse en tandem (MS/MS)

Comet est un moteur de recherche libre de base de données de séquences de spectrométrie de masse en tandem (MS/MS). Il identifie les peptides en recherchant dans les spectres MS/MS des séquences présentes dans les bases de données de séquences de protéines.

Ce paquet fournit un exécutable réalisant les recherches dans les bases de données MS/MS. Les formats de fichiers d'entrée pris en charge sont mzXML, mzML et ms2. Les formats de sortie pris en charge sont .out, SQT et pepXML.

Étiquettes: Biologie: Protéines, Rôle: Programme

Autres paquets associés à comet-ms

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libmstoolkit82 (>= 82) [x32]

  libraries for manipulating mass spectrometry data - runtime

• dep: libmstoolkit82t64 (>= 82) [non x32]

  libraries for manipulating mass spectrometry data - runtime

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

Télécharger comet-ms

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2019015+cleaned1-4.1	803,5 ko	2 469,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2019015+cleaned1-4.1	816,7 ko	2 389,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2019015+cleaned1-4.1	785,7 ko	2 341,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2019015+cleaned1-4.1	780,7 ko	2 356,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2019015+cleaned1-4.1	773,9 ko	2 224,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2019015+cleaned1-4.1	789,0 ko	2 346,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2019015+cleaned1-4.1	816,2 ko	2 428,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2019015+cleaned1-4.1	875,6 ko	2 939,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2019015+cleaned1-4.1	774,0 ko	2 368,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2019015+cleaned1-4.1	784,3 ko	2 432,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2019015+cleaned1-4.1	796,6 ko	2 472,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2019015+cleaned1-4.1	816,9 ko	2 469,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2019015+cleaned1-4.1	802,7 ko	2 297,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2019015+cleaned1-4.1	825,7 ko	2 625,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2019015+cleaned1-4.1	855,8 ko	2 404,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2019015+cleaned1-4.1	790,1 ko	2 922,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2019015+cleaned1-4	818,4 ko	2 376,0 ko	[liste des fichiers]