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[ Paquet source : artfastqgenerator  ]

Paquet : artfastqgenerator-examples (0.0.20150519-3)

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Paquets similaires :

création de fichiers FASTQ artificiels dérivés d'un génome de référence – exemples

ArtificialFastqGenerator prend en entrée un génome de référence au format FASTA et renvoie des fichiers FASTQ artificiels au format Sanger. Il accepte les scores de qualité Phred de bases depuis des fichiers FASTQ existants et s'en sert pour simuler des erreurs de séquençage. Puisque les fichiers FASTQ artificiels sont dérivés du génome de référence, celui-ci fournit une référence pour appeler les variantes (« Single Nucleotide Polymorphisms » (SNP) et insertions et suppressions (indels)). Cela permet d'évaluer une infrastructure d'analyse de séquençage de nouvelle génération (NGS) qui aligne les lectures avec le génome de référence puis appelle les variantes.

Ce paquet fournit les données d'exemples pour artfastqgenerator.

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all 1 262,3 ko1 271,0 ko [liste des fichiers]