Paquet : python3-pyani (0.2.12-3)

[ Paquet source : python-pyani  ]

module de Python 3 pour les analyses de l’identité moyenne des nucléotides

Pyani est un module de Python 3 et un script qui fournit une prise en charge du calcul de l’identité moyenne des nucléotides (ANI – Average Nucleotide Identity) et des mesures relatives pour des comparaisons du génome entier et le rendu d’une sortie de résumé graphique. Lorsque disponibles, il exploite les capacités de systèmes multicœurs et peut s’intégrer avec des organisateurs de tâches de type SGE/OGE pour les comparaisons de séquence.

Autres paquets associés à python3-pyani

• dep: mummer

  Alignement de séquence efficace de génomes complets

• dep: ncbi-blast+

  suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-matplotlib

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3

• dep: python3-pandas

  structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »

• dep: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• dep: python3-seaborn

  statistical visualization library for Python3

• dep: python3-setuptools

  Améliorations de Python3 Distutils

Télécharger python3-pyani

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	47,1 ko	208,0 ko	[liste des fichiers]