Paquet : tombo (1.5.1-7 et autres) [debports]

[ Paquet source :  ]

identification de nucléotides modifiés à partir de données brutes de séquençage par nanopores

Tombo est un ensemble d'outils conçu principalement pour identifier les nucléotides modifiés à partir de données de séquençage par nanopores. Tombo fournit aussi des outils pour l’analyse et la visualisation de signaux bruts de nanopores.

Autres paquets associés à tombo

• dep: libc6.1 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-h5py

  interface généraliste de Python pour hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3

• dep: python3-numpy2-abi0

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

  ou python3-numpy-abi9

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

• dep: python3-packaging

  core utilities for python3 packages

• dep: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Télécharger tombo

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.5.1-7+b1	483,3 ko	1 944,0 ko	[liste des fichiers]