[ Paquet source : srst2 ]
Paquet : srst2 (0.2.0-6)
Liens pour srst2
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source srst2 :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [katholt.github.io]
Paquets similaires :
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Autres paquets associés à srst2
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- dep: bowtie2
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
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- dep: cd-hit
- suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences
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- dep: python
- langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)
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- dep: python-biopython
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
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- dep: python-scipy
- outils scientifiques pour Python
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- dep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- rec: python-rpy2
- Python 2 interface to the GNU R language and environment (version 2.8)
Télécharger srst2
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 59,3 ko | 259,0 ko | [liste des fichiers] |