Paquet : snp-sites (2.4.1-1)

[ Paquet source : snp-sites  ]

code binaire pour le paquet snp-sites

Ce programme découvre les positions de polymorphisme d'un seul nucléotide (SNP) dans les fichiers d’entrée au format multi-fasta (pouvant être compressés). Sa sortie peut être dans divers formats largement utilisés (Multi Fasta Alignment, Vcf, phylip).

Ce logiciel a été développé à l’institut Wellcome Trust Sanger.

Un polymorphisme d’un seul nucléotide (SNP, prononcé snip, pluriel snips) est une variation de séquence d’ADN se produisant lorsque un seul nucléotide — A, T, C ou G — dans le génome (ou une autre séquence partagée) diffère entre membres d’une espèce biologique ou de paire de chromosomes. Par exemple, deux fragments d’ADN séquencés de deux individus différents, AAGCCTA à AAGCTTA, contiennent une différence dans un seul nucléotide. Dans ce cas, il y a deux allèles. La plupart des SNP communs ont seulement deux allèles.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, But: Analyse

Autres paquets associés à snp-sites

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [non arm64]

• dep: libsnp-sites1

  bibliothèques partagées du paquet snp-sites

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger snp-sites

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	11,0 ko	33,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	11,0 ko	33,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	10,7 ko	33,0 ko	[liste des fichiers]
i386	11,0 ko	33,0 ko	[liste des fichiers]