Paquet : dialign-tx-data (1.0.2-12)

[ Paquet source : dialign-t  ]

alignement de plusieurs séquences par segments – fichiers de données

DIALIGN-TX est un outil en ligne de commandes pour réaliser un alignement multiple de séquences de protéines ou d'ADN. C'est une ré-implémentation complète de l'approche basée sur les segments incluant plusieurs nouvelles améliorations et heuristiques qui améliore significativement la qualité des alignements en sortie comparée à DIALIGN 2.2 et DIALIGN-T. Pour les alignements par paires, DIALIGN-TX utilise un algorithme de « fragment- chaining » qui favorise les chaînes d'alignements locaux de faible score plutôt que les fragments isolés de score élevé. Pour l'alignement multiple, DIALIGN-TX utilise une procédure gloutonne améliorée qui est moins sensible aux fausses similitudes locales des séquences.

Ce paquet fournit les fichiers de matrices de similarité et de distribution de probabilité dont DIALIGN-TX a besoin pour aligner des séquences peptidiques et nucléiques.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Fait de: made-of::TODO, role::app-data

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• enh: dialign-tx

  alignement séquentiel multiple basé sur les segments

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