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Paquet : beagle-doc (5.0-180928+dfsg-1)

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documentation pour Beagle

Beagle réalise l'appel de génotype, le phasage de génotype, l'attribution de marqueurs non génotypés et la détection de segments identiques par descente. L'attribution génotypique fonctionne sur des haplotypes phasés grâce à un modèle de fréquence d'haplotype de Li et Stephens. Beagle implémente aussi l'algorithme IBD raffiné pour détecter les segments homozygotes par descente (HBD) et identiques par descente (IBD).

Ce paquet fournit la javadoc de l'API de Beagle et des exemples.

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