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Paquet : bppsuite (2.4.1-1)

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Paquets similaires :

suite de programmes Bio++

La suite de programmes Bio++ est un ensemble de programmes utilisant les bibliothèques Bio++ et dédiés à la phylogénétique et à l’évolution moléculaire. Tous les programmes sont indépendants mais peuvent être combinés pour réaliser des analyses complexes. Ces programmes utilisent les outils d’aide d’interface des bibliothèques et partagent donc la même syntaxe. Ils ont aussi plusieurs options communes, qui pourraient être partagées par des logiciels tiers.

Les programmes suivants sont inclus :

 – BppML pour une analyse de maximum de vraisemblance ;
 – BppSeqGen pour la simulation de séquences ;
 – BppAncestor pour la reconstruction d'états ancestraux ;
 – BppDist pour les méthodes de distance ;
 – BppPars pour l’analyse de parcimonie ;
 – BppSeqMan pour la conversion de fichiers et la manipulation de
   séquences ;
 – BppConsense pour construire des arbres de consensus et calculer des
   valeurs de démarrage (« bootstrap ») ;
 – BppReRoot pour le changement de racines d'arbre ;
 – BppTreeDraw pour le dessin d'arbres ;
 – BppAlnScore pour la comparaison d'alignements et le calcul de scores
   d'alignements ;
 – BppMixedLikelihood pour calculer les vraisemblances site par site des
   composants de modèles de mélange ;
 – BppPopGen pour les analyses génétiques de population.

Autres paquets associés à bppsuite

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 334,8 ko1 736,0 ko [liste des fichiers]
arm64 306,5 ko1 644,0 ko [liste des fichiers]
armel 274,6 ko1 312,0 ko [liste des fichiers]
armhf 281,3 ko1 108,0 ko [liste des fichiers]
i386 339,6 ko1 584,0 ko [liste des fichiers]
mips 301,0 ko1 706,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 307,5 ko1 897,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 307,5 ko1 706,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 328,5 ko2 292,0 ko [liste des fichiers]
s390x 299,8 ko1 724,0 ko [liste des fichiers]