Paquet : cwltool (1.0.20181217162649+dfsg-10)

[ Paquet source : cwltool  ]

implémentation de la référence du langage Common Workflow

C'est l'implémentation de référence des standards de Common Workflow Language.

Les standards ouverts CWL servent à décrire des analyses de flux de travail et des outils afin de les rendre portables et déployabls sur une grande diversité d'environnements logiciels et matériels, des stations de travail aux clustrs en passant par le cloud et le calcul haute performance (HPC). CWL a été conçu pour satisfaire les besoins des scientifiques manipulant beaucoup de données comme la bioinformatique, l'imagerie médicaale, l'astronomie, la physique et la chimie.

L'implémentation de la référence CWL (cwltool) vise à être entièrement personnalisée et à offrir une validation exhaustive de fichiers CWL, mais aussi d'autres outils de travail avec des descriptions CWL.

Étiquettes: Administration système: Automatisation et ordonnancement, Virtualisation, Domaine: field::astronomy, field::biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:molecular, Biologie structurale, field::medicine, field::physics, Mis en œuvre en: Python, Interface utilisateur: interface::commandline, role::program, Sciences: Calcul, Champ d'application: Utilitaire, Class of system: system::cloud, system::laptop, Serveur, Virtual, But: use::analysing, use::filtering, Format pris en charge: Étiquette supplémentaire nécessaire, Fonctionne avec: works-with::semantic-data, works-with::software:package

Autres paquets associés à cwltool

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-mypy

  public modules for mypy (Python 3)

• dep: python3-mypy-extensions

  Experimental type system extensions for mypy typechecker (Python 3)

• dep: python3-pkg-resources

  découverte de paquets et accès aux ressources avec pkg_resources

• dep: python3-prov

  W3C Provenance Data Model (Python 3)

• dep: python3-psutil

  module fournissant des fonctions pratiques pour la gestion de processus –⋅Python3

• dep: python3-rdflib

  Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers

• dep: python3-requests

  bibliothèque HTTP simple et élégante pour Python3, construite pour les êtres humains

• dep: python3-ruamel.yaml

  roundtrip YAML parser/emitter (Python 3 module)

• dep: python3-schema-salad

  Schema Annotations for Linked Avro Data (SALAD)

• dep: python3-shellescape

  escapes characters to safely assemble command lines

• dep: python3-six (>= 1.9.0)

  bibliothèque de compatibilité Python⋅2 et⋅3 –⋅interface Python⋅3

• dep: python3-typing-extensions

  Backported and Experimental Type Hints for Python

• rec: nodejs

  E/S par événement pour le moteur JavaScript V8

• sug: docker.io

  environnement d’exécution de conteneurs Linux

  ou singularity-container

  Paquet indisponible

Télécharger cwltool

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	171,4 ko	1 216,0 ko	[liste des fichiers]