Paquet : autodock-getdata (4.2.6-6)

[ Paquet source : autodocksuite  ]

instructions pour collecter des données pour getData

Ce paquet fournit les instructions pour que getData puisse récupérer les descriptions d'un ensemble de composés moléculaires qui peuvent ensuite être utilisés directement en entrée d'autodock. Les données ne sont pas fournies directement par ce paquet, seulement les instructions pour les télécharger.

Le projet FightAids@Home de la communauté internationale Grid fournit publiquement les ensembles d'entrée de leurs simulations. Les structures originelles proviennent de la base de données ZINC et ont été traitées depuis le format mol2 vers pdbqt par l'institut Scripps :

 - asinex ;
 - chembridge_buildingblocks_pdbqt_1000split ;
 - drugbank_nutraceutics ;
 - drugbank_smallmol ;
 - fda_approved ;
 - human_metabolome_pdbqt_1000split ;
 - otava ;
 - zinc_natural_products.

Merci de citer la base de données ZINC si vous utilisez leurs données.

Autres paquets associés à autodock-getdata

• rec: getdata

  management of external databases

• sug: autodock

  Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine

• sug: autodocktools

  Paquet indisponible

• sug: autogrid

  Pré-calculer les liaisons de ligands à leur récepteur

Télécharger autodock-getdata

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	18,4 ko	29,0 ko	[liste des fichiers]