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Paquet : spaln (2.4.1+dfsg-3)

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Paquets similaires :

alignement de transcriptions selon les épissures pour l’ADN génomique

Spaln (space-efficient spliced alignment) est un programme autonome qui cartographie et aligne un ensemble de séquences d’ADNc ou de protéines en une séquence générale en une seule passe. Il réalise aussi des alignements épissés ou ordinaires après une recherche rapide de similarité par rapport à une base de données de séquences de protéines si un segment génomique ou une séquence d’acides aminés est fourni en requête.

Spaln gère la combinaison de base de données de séquences de protéines et d’un segment génomique et réalise des recherches rapides de similarité et des alignements (semi)-globaux d’un ensemble de requêtes de séquences de protéines par rapport à une base de données de séquences de protéines. Spaln adopte une heuristique multiphase rendant le travail possible sur un ordinateur personnel conventionnel.

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Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 345,1 ko855,0 ko [liste des fichiers]
arm64 311,5 ko775,0 ko [liste des fichiers]
armel 296,6 ko781,0 ko [liste des fichiers]
armhf 303,3 ko589,0 ko [liste des fichiers]
i386 349,5 ko881,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 330,2 ko955,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 323,5 ko895,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 360,1 ko1 120,0 ko [liste des fichiers]
s390x 349,1 ko1 003,0 ko [liste des fichiers]