Paquet : scrappie (1.4.2-7)

[ Paquet source : scrappie  ]

basecaller for Nanopore sequencer

The Nanopore is a device for DNA/RNA sequencing that does not require an amplification of the material. The polynucleotides are threaded through a pore and while these pass through, the change in the electrostatic potential allows one to identify ("call") the actual base that resides in the pore. Scrappie goes a step further and also attempts to describe modifications to the nucleic acid.

Autres paquets associés à scrappie

• dep: libblas3

  implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

  ou libblas.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libhdf5-103-1

  HDF5 C runtime files - serial version

Télécharger scrappie

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	72 012,2 ko	88 430,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	17 912,3 ko	22 145,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	17 907,4 ko	22 001,0 ko	[liste des fichiers]
i386	44 820,9 ko	55 205,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	17 921,9 ko	22 231,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	17 966,0 ko	22 284,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	17 949,0 ko	22 169,0 ko	[liste des fichiers]