Paquet : plink (1.07+dfsg-3)

[ Paquet source : plink  ]

outils d'analyse d'associations sur le génome entier

Plink traite les données provenant de fragments SNP (single nucleotide polymorphism) de nombreux individus et leur description d'un phénotype pathologique. Il trouve les associations entre un phénotype et les variations d'ADN simple ou double brin et il peut récupérer les annotations SNP depuis une ressource en ligne.

Les SNP peuvent être analysés individuellement ou en tant que paires pour leur association avec les phénotypes pathologiques. L'étude conjointe des variations du nombre de copies est prise en charge. Divers tests statistiques ont été implémentés.

Remarque : l'exécutable a été renommé plink1 du fait d'un conflit de noms. Pour en savoir plus, lire /usr/share/doc/plink/README.Debian.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, But: Analyse

Autres paquets associés à plink

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libcrypt1 (>= 1:4.1.0)

  bibliothèque partagée libcrypt

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [non armel, armhf, ppc64el]

  Paquet indisponible

  dep: libgcc1 (>= 1:3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: med-config (>= 2.1)

  paquet de configuration générale de Debian Med

Télécharger plink

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 134,3 ko	3 269,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	964,7 ko	2 821,0 ko	[liste des fichiers]
armel	985,3 ko	2 964,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1 006,6 ko	2 096,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1 183,6 ko	3 668,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	981,6 ko	3 760,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	1 007,6 ko	3 869,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1 098,8 ko	3 509,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1 020,5 ko	3 381,0 ko	[liste des fichiers]