Paquet : pbbamtools (1.6.0+dfsg-2)

[ Paquet source : pbbam  ]

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.

This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.

Autres paquets associés à pbbamtools

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpbbam1.6.0 (= 1.6.0+dfsg-2)

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper1.8.0 (>= 1.8.0+dfsg)

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• rec: samtools

  traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

Télécharger pbbamtools

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	91,3 ko	354,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	81,3 ko	310,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	86,0 ko	369,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	90,3 ko	554,0 ko	[liste des fichiers]