Paquet : nanolyse (1.2.0-1)

[ Paquet source : nanolyse  ]

remove lambda phage reads from a fastq file

NanoLyse is a tool for rapid removal of contaminant DNA, using the Minimap2 aligner through the mappy Python binding. A typical application would be the removal of the lambda phage control DNA fragment supplied by ONT, for which the reference sequence is included in the package. However, this approach may lead to unwanted loss of reads from regions highly homologous to the lambda phage genome.

Autres paquets associés à nanolyse

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• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

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  Python3 interface minimap2

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	24,5 ko	66,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	24,5 ko	66,0 ko	[liste des fichiers]
armel	24,5 ko	66,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	24,5 ko	66,0 ko	[liste des fichiers]
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s390x	24,5 ko	66,0 ko	[liste des fichiers]