Paquet : allelecount (4.2.1-1)

[ Paquet source : allelecount  ]

algorithmes pour le compte de copies NGS

Ce paquet prend en charge le code des algorithmes de décompte de copies NGS. Il reçoit un fichier d'emplacements et un fichier [cr|b]am, puis génère un décompte de la couverture de chaque allèle (ACGT) à cet emplacement (avec des configurations de filtre données).

Le paquet allelecount existe essentiellement pour éviter la duplication de code entre certains autres projets, en particulier AscatNGS et Battenberg.

Autres paquets associés à allelecount

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [non arm64, ppc64el]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

Télécharger allelecount

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	27,9 ko	90,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	27,1 ko	86,0 ko	[liste des fichiers]
armel	27,5 ko	85,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	26,7 ko	77,0 ko	[liste des fichiers]
i386	28,5 ko	89,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	26,7 ko	92,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	26,6 ko	87,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	29,6 ko	118,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	27,0 ko	90,0 ko	[liste des fichiers]