Paquet : ltrsift (1.0.2-9)

[ Paquet source : ltrsift  ]

post-traitement et classification de rétrotransposons LTR

LTRsift est un outil graphique de bureau pour le post-traitement semi-automatique d’annotations de rétrotransposons, à séquence terminale longue répétée (LTR), de prédictions de novo, tels que ceux générés par LTRharvest et LTRdigest. Son interface conviviale affiche les candidats de rétrotransposon, leurs familles putatives et leurs structures internes de manière hiérarchique, permettant à l’utilisateur de « passer au crible » les résultats, parfois très importants, des logiciels de prédiction de novo. Il propose aussi des fonctions de filtrage et classification.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Interface utilisateur: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Champ d'application: Utilitaire, Boîte à outils d'interface utilisateur: GTK, But: use::analysing, use::browsing, Comparaison, Gestion de données, use::viewing, x11::application

Autres paquets associés à ltrsift

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [non arm64, ppc64el]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  GDK Pixbuf library (transitional package)

• dep: libgenometools0 (>= 1.6.1+ds)

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  bibliothèque GLib de routines C

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)

  bibliothèque d'interface graphique utilisateur GTK –⋅version ancienne

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Mise en place et rendu de texte internationalisé

• rec: last-align

  comparaison de séquences biologiques à l'échelle du génome

• rec: ncbi-blast+

  suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

Télécharger ltrsift

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	106,8 ko	377,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	96,1 ko	357,0 ko	[liste des fichiers]
armel	93,7 ko	327,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	95,2 ko	279,0 ko	[liste des fichiers]
i386	118,4 ko	439,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	87,6 ko	405,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	90,8 ko	416,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	106,2 ko	513,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	96,1 ko	381,0 ko	[liste des fichiers]