Paquet : gatb-core (1.4.2+dfsg-6)

[ Paquet source : gatb-core  ]

Genome Analysis Toolbox with de-Bruijn graph

The GATB-CORE project provides a set of highly efficient algorithms to analyse NGS data sets. These methods enable the analysis of data sets of any size on multi-core desktop computers, including very huge amount of reads data coming from any kind of organisms such as bacteria, plants, animals and even complex samples (e.g. metagenomes). Read more about GATB at https://gatb.inria.fr/. By itself GATB-CORE is not an NGS data analysis tool. However, it can be used to create such tools. There already exist a set of ready-to-use tools relying on GATB-CORE library: see https://gatb.inria.fr/software/

Autres paquets associés à gatb-core

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libcppunit-1.15-0

  Bibliothèque de test unitaire pour C++

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libhdf5-103-1

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger gatb-core

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2 485,4 ko	18 402,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2 277,9 ko	17 751,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2 536,6 ko	18 214,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2 386,6 ko	26 762,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2 678,1 ko	22 151,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2 236,9 ko	19 291,0 ko	[liste des fichiers]