Paquet : dascrubber (1.1-2)

[ Paquet source : dascrubber  ]

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Autres paquets associés à dascrubber

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [non arm64, ppc64el]

• sug: daligner

  alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Télécharger dascrubber

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	164,8 ko	1 185,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	142,4 ko	1 109,0 ko	[liste des fichiers]
armel	139,4 ko	1 139,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	137,6 ko	799,0 ko	[liste des fichiers]
i386	157,8 ko	1 327,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	135,9 ko	1 217,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	142,7 ko	1 279,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	165,9 ko	1 789,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	155,3 ko	1 237,0 ko	[liste des fichiers]