Paquet : bcftools (1.11-1)

[ Paquet source : bcftools  ]

appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF

BCFtools est un ensemble d'outils qui manipulent des appels de variation dans le format « Variant Call Format » (VCF) et son équivalent binaire BCF. Toutes les commandes fonctionnent de façon transparente avec VCF et BCF, qu'ils soient compressés avec BGZF ou non.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Rôle: Programme

Autres paquets associés à bcftools

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libhts3 (>= 1.11)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: sse2-support [i386]

  prevent installation on processors without required instructions

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• sug: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• sug: python3-matplotlib

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3

• sug: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

Télécharger bcftools

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	603,0 ko	2 183,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	549,0 ko	1 958,0 ko	[liste des fichiers]
armel	535,6 ko	1 928,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	535,2 ko	1 500,0 ko	[liste des fichiers]
i386	635,4 ko	2 212,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	555,7 ko	2 203,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	545,5 ko	2 021,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	641,5 ko	4 126,0 ko	[liste des fichiers]