Paquet : anfo (0.98-8)

[ Paquet source : anfo  ]

aligneur/mappeur de lectures courtes à partir de MPG

Anfo est un mappeur dans l'esprit de Soap/Maq/Bowtie, mais sa mise en œuvre relève plus de BLAST/BLAT. Il est plus utile pour l'alignement de séquences de lectures où la séquence ADN est quelque peu modifiée (pensez à de l'ADN ancien ou au traitement au bisulfite) et/ou il existe plus de divergence entre l'échantillon et la référence, que ces mappeurs rapides géreront avec élégance (considérant que le génome de référence est manquant, une variante proche est utilisée en lieu et place).

Autres paquets associés à anfo

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  bibliothèque d'aligneur/mappeur de lectures courtes à partir de MPG

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libelk0

  implementation of Scheme (the Extension Language Kit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, i386, mipsel]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  Bibliothèque pour analyser les paramètres de la ligne de commande

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.3)

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger anfo

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	113,9 ko	439,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	105,2 ko	395,0 ko	[liste des fichiers]
armel	99,8 ko	345,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	102,0 ko	305,0 ko	[liste des fichiers]
i386	119,6 ko	417,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	109,5 ko	438,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	110,5 ko	411,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	114,8 ko	619,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	104,0 ko	411,0 ko	[liste des fichiers]