Paquet : python3-pyranges (0.0.85+ds-1)

[ Paquet source : pyranges  ]

2D representation of genomic intervals and their annotations

A PyRanges object must have the columns Chromosome, Start and End. These describe the genomic position and function as implicit row labels. A Strand column is optional and adds strand information to the intervals. Any other columns are allowed and are considered metadata.

The structure can be filled from .bed, .bam or .gff files, also from tabular or textual representations.

Autres paquets associés à python3-pyranges

• dep: cython3

  extensions en⋅C pour Python⋅3

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-natsort

  Natural sorting for Python (Python3)

• dep: python3-ncls

  datastructure for interval overlap queries

• dep: python3-pandas

  structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »

• dep: python3-pyrle

  run length arithmetic in Python

• dep: python3-sorted-nearest

  bibliothèque d’assistance pour pyranges

• dep: python3-tabulate

  pretty-print tabular data in Python3

• sug: python-pyranges-doc

  Paquet indisponible

Télécharger python3-pyranges

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	425,1 ko	1 482,0 ko	[liste des fichiers]