Paquet : python3-unifrac (1.2-3 et autres)

[ Paquet source : unifrac  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains the Python3 module.

Autres paquets associés à python3-unifrac

• dep: cython3

  extensions en⋅C pour Python⋅3

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el]

• dep: libssu0 (>= 1.2)

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-biom-format

  format de matrice d'observation biologique (BIOM) – Python 3

• dep: python3-h5py (>= 3.3.0)

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-iow

  balanced parentheses tree structure

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• dep: python3-skbio (>= 0.5.8-3~)

  Python3 data structures, algorithms, educational resources for bioinformatic

Télécharger python3-unifrac

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.2-3+b1	118,7 ko	619,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.2-3+b1	109,2 ko	606,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.2-3+b1	106,4 ko	676,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.2-3+b1	120,5 ko	670,0 ko	[liste des fichiers]