Paquet : r-bioc-snpstats (1.48.0+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-snpstats  ]

méthodes et les classes de SnpMatrix et XSnpMatrix de BioConductor

Ce paquet de BioConductor fournit des fonctions R pour travailler avec les méthodes et les classes de SnpMatrix et XSnpMatrix.

La nécessité de SnpStats découle du besoin de stocker et d’analyser des données de génotypes PNS dans lesquels le sujet ne peut être à coup sûr assigné à un des trois génotypes possibles. Cela nécessitait un changement dans la manière dont les données sont stockées en interne, bien que snpStats puisse encore gérer les données de génotype nommées conventionnellement dans le mode de stockage originel de snpMatrix. snpStats manque actuellement de certaines fonctions qui étaient présentes dans snpMatrix (bien que, heureusement, les lacunes importantes seront bientôt comblées), mais inclut aussi plusieurs fonctions importantes.

Autres paquets associés à r-bioc-snpstats

• dep: libc6 (>= 2.7)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• dep: r-cran-survival

  paquet GNU R pour l'analyse de survie

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: r-cran-hexbin

  GNU R hexagonal binning routines

Télécharger r-bioc-snpstats

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
mipsel	7 039,0 ko	8 500,0 ko	[liste des fichiers]