Paquet : smrtanalysis-dev (0~20210112)

[ Paquet source : smrtanalysis  ]

develepment libraries for smrtanalysis

SMRT® Analysis is a powerful, open-source bioinformatics software suite available for analysis of DNA sequencing data from Pacific Biosciences’ SMRT technology. Users can choose from a variety of analysis protocols that utilize PacBio® and third-party tools. Analysis protocols include de novo genome assembly, cDNA mapping, DNA base-modification detection, and long-amplicon analysis to determine phased consensus sequences.

This is a metapackage that depends on the SMRTAnalysis development tools.

Étiquettes: Développement de logiciel: Bibliothèques, Rôle: Bibliothèque de programmation

Autres paquets associés à smrtanalysis-dev

• dep: libpbbam-dev

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library (headers)

• dep: libpbseq-dev

  library for analyzing PacBio sequencing data (development files)

• dep: python3-pbcommand

  common command-line interface for Pacific Biosciences analysis modules

• dep: python3-pbconsensuscore

  algorithms for PacBio multiple sequence consensus -- Python 3

• dep: python3-pbcore

  bibliothèque de Python 3 pour traiter les fichiers de données de PacBio

• sug: python-kineticstools

  Paquet indisponible

• sug: python-pbalign

  Paquet indisponible

• sug: python-pbgenomicconsensus

  Paquet indisponible

• sug: python-pbh5tools

  Paquet indisponible

Télécharger smrtanalysis-dev

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	3,1 ko	9,0 ko	[liste des fichiers]