Paquet : libbio-db-hts-perl (3.01-4 et autres)

[ Paquet source : libbio-db-hts-perl  ]

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Autres paquets associés à libbio-db-hts-perl

• dep: libbio-perl-perl

  modules Perl principaux de BioPerl

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: perl (>= 5.36.0-4)

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• dep: perlapi-5.36.0

  paquet virtuel fourni par perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger libbio-db-hts-perl

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	3.01-4+b1	153,2 ko	444,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	3.01-4+b1	147,7 ko	487,0 ko	[liste des fichiers]
armel	3.01-4+b1	149,8 ko	487,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	3.01-4+b1	149,0 ko	487,0 ko	[liste des fichiers]
i386	3.01-4+b1	154,5 ko	459,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	3.01-4+b1	143,2 ko	560,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	3.01-4+b1	143,4 ko	558,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	3.01-4+b1	150,9 ko	552,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	3.01-4+b1	150,3 ko	457,0 ko	[liste des fichiers]