Paquet : ipig (0.0.r5-4)

[ Paquet source : ipig  ]

intégration de PSM dans des visualisations de navigateur de génome

iPiG targets the integration of peptide spectrum matches (PSMs) from mass spectrometry (MS) peptide identifications into genomic visualisations provided by genome browser such as the UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG takes PSMs from the MS standard format mzIdentML (*.mzid) or in text format and provides results in genome track formats (BED and GFF3 files), which can be easily imported into genome browsers.

Autres paquets associés à ipig

• dep: libcommons-compress-java

  Java API for working with compression and archive formats

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libjdom1-java

  lightweight and fast library using XML

• dep: libxerces2-java

  validateur et analyseur XML pour Java avec la gestion de DOM niveau 3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	160,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	160,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
armel	160,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	160,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
i386	160,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	161,0 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	160,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	160,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	160,9 ko	186,0 ko	[liste des fichiers]