toutes les options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Paquet source : plip  ]

Paquet : plip (2.2.2+dfsg-1)

Liens pour plip

Screenshot

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source plip :

Responsables :

Ressources externes :

Paquets similaires :

fully automated protein-ligand interaction profiler

The Protein-Ligand Interaction Profiler (PLIP) is a tool to analyze and visualize protein-ligand interactions in PDB files.

Features include:

 * Detection of eight different types of noncovalent interactions
 * Automatic detection of relevant ligands in a PDB file
 * Direct download of PDB structures from wwPDB server if valid
   PDB ID is given
 * Processing of custom PDB files containing protein-ligand complexes
   (e.g. from docking)
 * No need for special preparation of a PDB file, works out of the box
 * Atom-level interaction reports in rST and XML formats for easy parsing
 * Generation of PyMOL session files (.pse) for each pairing, enabling easy
   preparation of images for publications and talks
 * Rendering of preview image for each ligand and its interactions
   with the protein

Autres paquets associés à plip

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances

Télécharger plip

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
all 82,3 ko383,0 ko [liste des fichiers]