Paketti: blast2 (1:2.2.26.20120620-2)

[ Source: ncbi-tools6  ]

Basic Local Alignment Search Tool

The famous sequence alignment program. This is "official" NCBI version, #2. The blastall executable allows you to give a nucleotide or protein sequence to the program. It is compared against databases and a summary of matches is returned to the user.

Note that databases are not included in Debian; they must be retrieved manually.

Tagit: Biology: biology::nuceleic-acids, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Tiede: science::calculation, scope::utility, Purpose: Searching, Works with: Biological Sequence

Muut pakettiin blast2 liittyvät paketit

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.13-28) [armhf]

  dep: libc6 (>= 2.7) [ei armhf, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  Sulautettu GNU C -kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libncbi6 (<< 6.1.20120620.1)

  NCBI libraries for biology applications

  dep: libncbi6 (>= 6.1.20120620)

• sug: libvibrant6a

  NCBI libraries for graphic biology applications

• sug: ncbi-rrna-data

  large rRNA BLAST databases distributed with the NCBI toolkit

• sug: ncbi-tools-bin

  NCBI libraries for biology applications (text-based utilities)

• sug: ncbi-tools-x11

  NCBI libraries for biology applications (X-based utilities)

Imuroi blast2

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	666.3 kt	1,285.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	659.0 kt	1,205.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	619.9 kt	1,105.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	651.4 kt	1,222.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64	738.3 kt	1,586.0 kt	[tiedostoluettelo]
kfreebsd-amd64	651.6 kt	1,228.0 kt	[tiedostoluettelo]
kfreebsd-i386	634.1 kt	1,138.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips	625.9 kt	1,188.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	621.3 kt	1,188.0 kt	[tiedostoluettelo]
powerpc	651.7 kt	1,222.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390	662.8 kt	1,255.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	671.7 kt	1,356.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc	637.4 kt	1,221.0 kt	[tiedostoluettelo]