Paketti: ssw-align (1.1-14 ja muut)

[ Source: libssw  ]

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Muut pakettiin ssw-align liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libssw0 (= 1.1-14+b1)

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ei armel, armhf]

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

Imuroi ssw-align

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.1-14+b1	23.6 kt	64.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.1-14+b1	20.5 kt	83.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.1-14+b1	23.9 kt	63.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.1-14+b1	22.2 kt	51.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.1-14+b1	26.9 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.1-14+b1	26.1 kt	85.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.1-14+b1	20.1 kt	84.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.1-14+b1	27.4 kt	72.0 kt	[tiedostoluettelo]