Paketti: python3-htseq (2.0.9+dfsg-1 ja muut) [debports]

[ Source:  ]

Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

Muut pakettiin python3-htseq liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.41)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

  tai python3-numpy-abi9

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

Imuroi python3-htseq

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
sh4 (epävirallinen siirros)	2.0.9+dfsg-1+b3	447.6 kt	1,693.0 kt	[tiedostoluettelo]