Paketti: tantan (49-2)

[ Source: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with::biological-sequence

Muut pakettiin tantan liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ei armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Imuroi tantan

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	39.0 kt	145.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	41.1 kt	120.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	37.1 kt	144.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	36.9 kt	103.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	34.8 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	39.5 kt	105.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	43.5 kt	119.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	51.1 kt	200.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	38.2 kt	111.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	41.1 kt	149.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	44.0 kt	144.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	44.0 kt	144.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	40.6 kt	92.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	44.2 kt	124.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	47.7 kt	143.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	34.6 kt	1,042.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	41.1 kt	115.0 kt	[tiedostoluettelo]